プランニング等の問題以前に、各自治体の保健所等に事前に協議をしに行く事をお勧めいたします。飲食店計画の場合、保健所指導のもとに出店プランを作成する事が必須条件となりますが、動物を絡めた店舗形態の場合、各自治体の判断が大きく異なる事があります。具体的なプランニングに進む前に、保健所等から意見を聞いておく必要があるかと思います。

ヒトが飲食や動物とのふれあいを楽しむ場所であると同時に、生き物が日々暮らしている場所でもあることを注意して設計するようにします。
臭いや汚れなどは必ずでてきますので、衛生的で清掃のしやすい造りや設備を整えることが大事だと思います。
また、保健所に対して、飲食店の営業許可以外にも動物を扱う為の資格や申請が必要です。施設基準を満たしているのか事前に確認しましょう。

基本的に掃除がし易い内装にする事、清潔な店内を継続できる素材を使用して。床は滑らない仕上げにして壁等に丸みを持たせて動物が怪我をしない様な空間設計を心掛ける

床等にウレタン等のケミカルな素材を使うのはタブーです。できるだけ天然素材をつかうほうが動物にストレスがかからないでしょう。

動物は室内の床材を、滑りやすいものにすると股間接を痛めてしまうので、掃除のし易さと滑りにくさのバランスを見て材料を選択されるのが、良いと思います。

動物カフェでポイントは①清潔感②面白さ③距離感かと思います。
清潔感ですが、動物と生活しているとどうしても臭いが気になることがあります。カフェであればなおさらです。汚れにくい物を使用することが必須かと思います。
面白さですが、動物カフェに行く方は動物好きが多いかと思いますが動物達の愛らしさをさらに引き出せるようなアイディアも重要です。
最後に距離感ですが人の事を考えると共に動物からしたらどうなのかという事も踏まえる事が大切かと思います。